La Universidad Nacional del Este se encuentra comprometida con la Agencia Nacional de Evaluación y Acreditación de la Educación Superior (ANEAES) en la implementación del Mecanismo Experimental de Autoevaluación y Acreditación Institucional.
La UNE asume este proceso como un instrumento para diagnóstico y evaluación integral de las políticas y mecanismos de gestión que se vienen implementando apuntando al mejoramiento continuo y el aseguramiento de la calidad en todos los ámbitos del desempeño de las Unidades Académicas que la conforman.
La Universidad a través de la Dirección General Académica, establece la coordinación para su implementación buscando aunar esfuerzos y aplicar en forma sistemática los procedimientos establecidos por la ANEAES.
Se espera que el esfuerzo de cada una de las Unidades Académicas sean coronadas en un informe final que presente la situación de la gestión respecto a los criterios e indicadores de calidad establecidos y resulten en un compromiso de toda la UNE en la búsqueda sostenida de la mejora para brindar educación superior de calidad.